В структуру ООО «Санаторий «Карагайский бор» входит:
1. Лечебный корпус: зал ЛФК, кабинет психологической разгрузки, физиотерапевтические кабинеты, сухие углекислые ванны, озонотерапия, кабинет мануальной терапии, иглорефлексотерапии, ванный зал (жемчужные ванны, скипидарные, йодобромные, ароматизированные ванны), грязелечение, спелеошахта, магнитно-терапевтический комплекс «Алма», кабинеты врачей, лаборатория.
2. Лечебно-оздоровительный комплекс: бассейн , сауна, спелеошахта, подводный душ-массаж, водная кафедра, ингаляторий, зал ЛФК, тренажерный зал, сухие углекислые ванны, кабинет механотерапии, физиотерапевтический кабинет, питьевой бювет.
3. Три спальных корпуса. ,
4. 1 этаж 2 спального корпуса ( палата интенсивной терапии, изолятор, процедурный кабинет, пост медицинской сестры, кабинет неотложной медицинской помощи - круглосуточный, кабинет физиотерапии , кабинет психологической разгрузки, кабинет механотерапии, кабинет функциональной диагностики , кабинет массажа, кабинеты врачей.)
5. Цех по разливу минеральной воды.
6. Два культурно-развлекательных комплекса.
7. Пищеблок.
8. Служба охраны.
9. Кафе - бар "Уют".
10. Стоянки.
11. Фитобар.
12. Пункт проката спортинвентаря.
13. Пляж с лодочной станцией.
14. Тренажерный зал
В 2016 году организовано отделение медицинской реабилитации (специализированная, стационарная помощь).